生物信息学实验室于2013年9月开始申报筹建,2014年3月建成。实验室的依托单位为基础医学实验中心。
一、定位及研究方向
本实验室主要负责生物信息学专业课学生上机实训、全校Linux课程的公选课上机操作、以及专业学生课后实验、毕业设计以及各类创新项目。
二、实验室管理
为了科学管理以及提高实验室的使用效率,实验室依据学校制定的《重庆医科大学大学生科学研究与创新实验项目管理办法》,以及结合本专业实际制定了《生物信息学专业实验室管理规范》等管理制度来规范和加强学生的专业实验以及创新实践。目前该实验室由专人管理,每天定期对专业学生开放。
三、实验室承担的课程及项目
1、专业实验课
生物信息学专业课程开设的实验课有《C语言程序设计》、《操作系统》、《R语言》、《数据库原理及应用》、《生物统计学》、《计算基因组学》、《生物信息学》、《现代生物计算环境》以及《shell编程》等9门课程,累计实验学时有264学时。
2、公选课
每学期全校的Linux操作系统公选课程180人(4*16学时)的上机操作。
3、毕业设计
每年专业学生(按照每年35人计算)的毕业设计及各类创新实验,近2年接纳本专业本科生开展各类创新实验和学院的《英耀资助计划》6项,实验室的开放,对推动专业学生的专业实践能力和发展奠定了重要基础。
四、实验室教师介绍
冉隆科,博士,副教授,硕士研究生导师,教研室副主任,实验室负责人。目前研究方向:生物信息学。
唐娅琴,硕士,讲师。目前研究方向:软件工程及数据挖掘。
谭鹏程,硕士,讲师。目前研究方向:图像处理与数据挖掘。
彭睿,在读博士,讲师。目前研究方向:系统生物学。
五、实验室承担的基础医学院英耀计划项目(近2年)
项目批准时间 | 项目名称 | 学生姓名 | 指导老师 | 资助金额 |
2016-11 | TNF-α在促使椎间盘退化的炎症反应过程中关键基因的筛选与鉴定 | 金鹏 | 冉隆科 | 1.5万 |
2016-11 | 拟南芥转录调控网络研究 | 罗仕涛 | 彭睿 | 1万 |
2016-11 | 生物信息学筛选口腔鳞状细胞癌转移基因及验证 | 周小吉 | 冉隆科 | 0.5万 |
2017-12 | Caenorhabditis elegans多层次连接组中的前馈与反馈回路研究 | 龚月 | 彭睿 | 2万 |
2017-12 | 识别转移性前列腺癌的差异表达基因及其上游调节因子 | 孙馥香
| 冉隆科 | 0.5万 |
2017-12 | 基于生物信息学方法检测GSC基因与先天性小耳畸形的关系 | 张丽 | 冉隆科 | 0.5万 |
六、实验室现有仪器设备
HP DL580 G7服务器1台
山特C2KS 1600W UPS 续航30分钟1台
爱普生EB-C745WN 投影仪1个
柜式空调机5P 1台
宏碁商用电脑 Veriton D430 计算机48台
宏碁商用电脑 Veriton D630 计算机2台
HP laser jet 1020plus高速激光打印机1台
H3C S5120-28P-SI交换机1台
H3C S5120-52P-SI交换机1台
三维135寸电动幕布 1张
八、联系方式
联系人:冉隆科
电话:15922710767
电子信箱:ranlongke@cqmu.edu.cn
编码:401331
地址:重庆市沙坪坝区大学城中路61号A1-1408室
生物信息学实验室效果图